
PMseq Datician病原專家分析系統(tǒng)是華大基因(300676)自主開發(fā)的智能集成化本地生信分析服務(wù)器,可與PMseq 病原高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)過程自動(dòng)偶聯(lián),一鍵智能生成檢測(cè)報(bào)告,無需專業(yè)的生信分析人員,保證了數(shù)據(jù)安全和結(jié)果準(zhǔn)確。
基于PMseq Datician病原專家分析系統(tǒng)的PM Display、PM Online組件,可輕松實(shí)現(xiàn)線上數(shù)據(jù)管理分析、報(bào)告智能生成功能,讓PMseq 組學(xué)大數(shù)據(jù)分析簡(jiǎn)單易用!
PM Display智能報(bào)告系統(tǒng)
PM Display智能報(bào)告系統(tǒng)是配套PMseq 病原微生物高通量測(cè)序產(chǎn)品的組學(xué)大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)對(duì)PMseq 病原檢測(cè)后的檢測(cè)結(jié)果歸集、存儲(chǔ)、統(tǒng)計(jì)、分析、數(shù)據(jù)挖掘。使用可視化操作界面,人工確定檢出病原為最終臨床報(bào)告。該系統(tǒng)帶自我學(xué)習(xí)功能,在使用過程中不斷結(jié)合用戶給出的結(jié)果優(yōu)化默認(rèn)推薦病原,并能結(jié)合PM Online給出不同病原的檢出分布。
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PM Online線上數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)
PM Online線上數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)集成了PMseq 自動(dòng)化病原分析數(shù)據(jù)平臺(tái),使得病原鑒定組學(xué)數(shù)據(jù)在中心本地化集中存儲(chǔ),實(shí)現(xiàn)用戶在線授權(quán)訪問,可以協(xié)助醫(yī)院實(shí)現(xiàn)病原組學(xué)檢測(cè)數(shù)據(jù)管理、病原統(tǒng)計(jì)、檢出頻率、病原譜和時(shí)空分布等統(tǒng)計(jì)分析功能;并且支持?jǐn)?shù)據(jù)共享合作,臨床和基因組學(xué)科學(xué)研究,可為醫(yī)院及疾控等機(jī)構(gòu)的大數(shù)據(jù)分析與再挖掘提供強(qiáng)有力的技術(shù)平臺(tái)支撐。

升級(jí)亮點(diǎn)
數(shù)據(jù)定時(shí)交互
PM Display與PM Online進(jìn)行數(shù)據(jù)定時(shí)交互,實(shí)現(xiàn)報(bào)告解讀到數(shù)據(jù)收集統(tǒng)計(jì)的一體化和自動(dòng)化。

更完善!更全面!更科學(xué)!
PMseq 報(bào)告配置不斷更新升級(jí),使其更完善!更全面!更科學(xué)!配置PMseq 默認(rèn)報(bào)告模板以及個(gè)性化報(bào)告模板;上線“檢出疑似耐藥基因列表”和“檢出疑似毒力基因列表”;升級(jí)“參考文獻(xiàn)”和“微生物說明”數(shù)據(jù)庫!


報(bào)告節(jié)選
數(shù)據(jù)更豐富
新增“樣本類型特異性的病原微生物檢出率”,輔助解讀人員對(duì)出列微生物更好地判讀。
助力城市Q熱疫情流行監(jiān)控
2021年7月,中山大學(xué)附屬第五醫(yī)院聯(lián)合華大基因研究團(tuán)隊(duì),在國(guó)際期刊《PLoS Negl Trop Dis》(IF=4.4) 上發(fā)表一篇科學(xué)論文,闡述了2018年底至2019年初,研究者利用宏基因組測(cè)序技術(shù) (mNGS) 在珠海監(jiān)控到了城市Q熱疫情流行[1]。
研究者對(duì)疑似感染的未知病原發(fā)熱查因患者進(jìn)行PMseq 檢測(cè),監(jiān)測(cè)到中大五院2018年4月份開始檢測(cè)到貝納特柯克斯體,確診Q熱病例,并在接下來的十幾個(gè)月中持續(xù)檢測(cè)到該病原體,且在2018年底和2019年初達(dá)到了檢出率的高峰。
研究者在該病原體檢出最高峰時(shí)期采集了珠海市唯一屠宰場(chǎng)的牛、羊血液,同樣用PMseq 檢測(cè)到了較高比例的貝納特柯克斯體陽性樣本。然后,研究者利用該批病人的手機(jī)定位數(shù)據(jù),結(jié)合牛、羊樣本檢測(cè)結(jié)果,推測(cè)了一起可能由動(dòng)物傳染、聚集傳播的城市Q熱流行事件[1]。

病原體mNGS檢測(cè)已經(jīng)全新開啟醫(yī)院本地化建設(shè)的新篇章?;赑Mseq Datician病原專家分析系統(tǒng)的PM Display、PM Online組件升級(jí),助力數(shù)據(jù)管理及報(bào)告解讀更智能,讓病原宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)簡(jiǎn)單易用!華大基因?qū)⒉恍概μ嵘a(chǎn)品質(zhì)量,為臨床精準(zhǔn)診療提供更全面的解決方案,讓更多百姓受益于基因科技。