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基因治療先驅(qū),為什么掉隊了?

作者:張玨 來源: 動脈網(wǎng) 156305/10

Sangamo Therapeutics,這家1995年成立的基因治療先驅(qū)近來煩心事不少。近日,Sangamo 宣布了戰(zhàn)略調(diào)整計劃,這也意味著公司要在美國裁員27%。通過業(yè)務和結(jié)構調(diào)整和其他計劃采取的降本舉措,Sangamo預計每年可節(jié)省約

標簽: 基因治療 Sangamo CRISPR技術

Sangamo Therapeutics,這家1995年成立的基因治療先驅(qū)近來煩心事不少。

近日,Sangamo 宣布了戰(zhàn)略調(diào)整計劃,這也意味著公司要在美國裁員27%。通過業(yè)務和結(jié)構調(diào)整和其他計劃采取的降本舉措,Sangamo預計每年可節(jié)省約3100萬美元,為公司提供接下來12個月的運營資金。此外,技術運營執(zhí)行副總裁 R. Andrew Ramelmeier 博士將于今年7月離開公司。

3月17日,公司公告稱Novartis和Biogen分別決定終止了合作協(xié)議:與Novartis合作始于2020年7月,基于ZFN共同開發(fā)三個臨床前CNS管線;與Biogen合作始于2020年2月,基于ZFN和AAV載體共同開發(fā)治療tau蛋白病的ST-501、治療PD的ST-502、靶向DM1等四種臨床前基因療法。

去年1月,公司公告稱Sanofi決定終止合作協(xié)議:這項始于2014年1月的合作,基于ZFN共同開發(fā)治療SCD的臨床前通用型細胞治療藥物,終止前已進入I/II期臨床。

Sangamo的市值已從高點的26億美元,一路滑落至2.7億。

Sangamo因其堅持——或者說壟斷ZFN技術路線而知名,總裁兼首席執(zhí)行官和董事會成員Sandy Macrae博士曾獲得過諾貝爾醫(yī)學獎(2013年)提名。廣泛的涉及領域、獨特的研究平臺,還有奪目的合作管線,Sangamo一直是基因治療領域的旗幟之一,但現(xiàn)在,這面孤獨的旗幟好像已經(jīng)失去了榮耀和色彩。

在Sangamo與ZFN技術風雨飄搖時,另一邊,CRISPR技術又傳來新的重磅融資:Beam衍生公司Orbital獲2.7億美元A輪融資,Orbital 將 LNP 和 VLP 以及環(huán)狀 RNA 結(jié)合在一起,正在 RNA 技術、遞送方法、數(shù)據(jù)科學和自動化的交叉點構建一個技術平臺,涉足下一代疫苗、蛋白質(zhì)替代品和免疫調(diào)節(jié)劑,并正與大型制藥公司在內(nèi)的潛在合作伙伴溝通合作。

ZFN與CRISPR作為兩代基因編輯工具,其冰火兩重天的現(xiàn)狀值得玩味。

ZFN獨行俠

Sangamo Therapeutics公司總部位于美國加州里士滿,于2000年上市。在公司時任CEO Edward Lanphier的努力下,ZFN技術從設計、優(yōu)化到臨床應用的整套技術體系的專利被Sangamo*鎖定,再也沒有其它機構從事ZFN的研發(fā)。

ZFN是一個帶定位系統(tǒng)的基因剪刀,鋅指蛋白用于識別和結(jié)合特定的基因序列,F(xiàn)okI核酸內(nèi)切酶可以通過二聚體化特異性地切割目的基因,并且可以切割真核基因組的任意識別序列。

ZFN的主要優(yōu)勢在于基因修復方式多樣、精準更換基因、對基因表達強度影響較小。與CRISPR相比,ZFN作為基因編輯工具的主要劣勢是開發(fā)高質(zhì)量基因編輯產(chǎn)品費時且繁瑣。雖然這種明顯的差異仍然存在,但Sangamo已經(jīng)改進了開發(fā)過程,周期由三個月縮短至10天,并減少了它的費用。

由于Sangamo的研究和開發(fā)工作,ZFN在基因編輯領域取得了多項*:*個編輯人類細胞基因、*個編輯體外基因和*個編輯體內(nèi)基因。

Sangamo具有先發(fā)優(yōu)勢,但從ZFN被發(fā)現(xiàn)到現(xiàn)在已近40年,Sangamo成立也近30年,公司還尚未有沖線的產(chǎn)品。反觀更晚起步的CRISPR,今年已經(jīng)撞線在即,Vertex Pharmaceuticals 和 CRISPR Therapeutics 提交了用于鐮狀細胞病和 β 地中海貧血治療的 exa-cel 的 BLA 申請,Bluebird bio 提交了基因治療 lovo-cel 上市申請(BLA),用于 12 歲及以上有血管閉塞事件史的鐮狀細胞?。⊿CD)患者治療。

根據(jù)Sangamo的公開信息,其進度最快的管線是與輝瑞公司合作的血友病A項目(此前的SB-525),為肝靶向 AAV 基因療法,輝瑞正在主導臨床III期的研究,以評估在中度或重度 A 型血友病成年男性參與者中的臨床療效和安全性。

▲ Sangamo公司最新管線情況,來源:公司Q1財報

在Sangamo的*季度財報電話會上,公司宣布了接下來的三大戰(zhàn)略重點:

Nav1.7和Prion,這是Sangamo神經(jīng)學表觀遺傳調(diào)控領域的重點臨床前項目,Nav1.7用于治療慢性神經(jīng)性疼痛,預計將于2024年提交IND,Prion計劃在2025年提交IND。

針對法布瑞氏癥(此前的ST-920)的III期臨床準備,該病是因X染色體上出現(xiàn)缺陷而導致的遺傳疾病,它主要是因制造α-半乳糖甘酵素的基因發(fā)生缺陷,Sangamo表示其產(chǎn)品在I/II期試驗中已展現(xiàn)出良好的安全性,正在推進III期試驗的計劃。

TX200 CAR-Treg 臨床研究,TX200用于實體器官移植,Sangamo計劃通過I/II期臨床研究推進 TX200在腎移植中的應用,并計劃加速劑量遞增。

從公司最新的管線列表可以看到,Sangamo的重點項目全部為自有管線,合作項目和此前比可以用寥寥無幾來形容。Sangamo在獨行俠的路上似乎越走越遠。

技術發(fā)展,需要開枝散葉

當業(yè)內(nèi)對比ZFN與CRISPR時,無一不提到ZFN面臨的一大問題是專利上的封鎖。

專利一直是基因治療領域的關鍵競爭壁壘,Sangamo干脆從源頭避免這個問題,所以ZFN領域只有Sangamo自己摸索前路,這也導致ZFN技術自問世至今沒有獲得大規(guī)模的應用,也沒有突破性進展。

CRISPR技術則在“不那么體面”的專利之爭中迅速發(fā)展。2013年11月,張鋒連同Doudna等人共同建立了Editas Medicine,但最終由于專利方面未談攏,Doudna便選擇了單飛并于2014年創(chuàng)立了Intellia Therapeutics。此外,Charpentier也沒有閑著,其同樣于2013年創(chuàng)立了CRISPR Therapeutics。如今,這三家企業(yè)已成為CRISPR基因編輯技術領域的頭部企業(yè)。

CRISPR在一路的專利紛爭中,不斷有細分路徑出現(xiàn),如2016年堿基編輯出現(xiàn),可以做到定點的修飾某一個或者某幾個點突變,能夠定向改變基因組中某個特定位置的特定堿基,并且只改變單個目標堿基,而不會影響到其他堿基;2019年劉如謙博士公開的引導編輯可以實現(xiàn)4種堿基之間的任意變換及小片段的精準插入和刪除。

▲ ZFN與CRISPR技術相關公司時間線/ 動脈新醫(yī)藥整理

針對專利問題,布局CRISPR技術的眾多公司一方面想辦法繞開CRISPR-Cas9,另一方面,在想辦法爭奪尚未塵埃落定的專利。輝大基因自主開發(fā)的CRISPR-Cas13系統(tǒng)——Cas13X(也稱為Cas13e)和Cas13Y(也稱為Cas13f),既可以降低RNA的靶基因表達,還可以通過改造與脫氨酶結(jié)合進而實現(xiàn)RNA單堿基編輯,且編輯效率接近80%;吐露港生物(ToloBio)在美國申請Cas12蛋白診斷專利,公司利用Cas12a的反式切割活性開發(fā)了HOLMES診斷系統(tǒng),在專利上與Mammoth Biosciences展開了艱難的競爭并擊敗對手。

這一切,讓CRISPR領域更顯百花齊放的狀態(tài)。

反觀Sangamo,公司之外的科學家們?nèi)詿o法了解其篩選和優(yōu)化ZFN技術的詳細過程,在此之上的進一步完善和進步當然無從談起。要讓技術飛速成長、開花結(jié)果,Sangamo公司內(nèi)部的少數(shù)科學家遠遠不足以實現(xiàn)這一目標。就算學術界的科學家想要利用Sangamo公司的技術進行基礎研究,比如對某個生物的基因進行定點突變并研究其生理功能,也只能委托Sangamo公司設計和完成,堪稱是黑箱操作。ZFN原本基礎研究和臨床應用方面都表現(xiàn)出色,卻被限制在Sangamo公司內(nèi)部,無法釋放其潛力,喪失了原本的先發(fā)優(yōu)勢。

從某種意義上說,Sangamo公司對專利的*保護,作為商業(yè)實踐可能還是會寫進許多商學院和法學院的案例教材,被人長久討論,但ZFN技術和其相關的研究是否能被銘記,要被打一個問號。畢竟不論在科學上的爭執(zhí)還是商業(yè)上的競賽,最終是為了釋放造福人類的潛力。

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