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基因治療先驅(qū),為什么掉隊(duì)了?

作者:張玨 來(lái)源: 動(dòng)脈網(wǎng) 158405/10

Sangamo Therapeutics,這家1995年成立的基因治療先驅(qū)近來(lái)煩心事不少。近日,Sangamo 宣布了戰(zhàn)略調(diào)整計(jì)劃,這也意味著公司要在美國(guó)裁員27%。通過(guò)業(yè)務(wù)和結(jié)構(gòu)調(diào)整和其他計(jì)劃采取的降本舉措,Sangamo預(yù)計(jì)每年可節(jié)省約

標(biāo)簽: 基因治療 Sangamo CRISPR技術(shù)

Sangamo Therapeutics,這家1995年成立的基因治療先驅(qū)近來(lái)煩心事不少。

近日,Sangamo 宣布了戰(zhàn)略調(diào)整計(jì)劃,這也意味著公司要在美國(guó)裁員27%。通過(guò)業(yè)務(wù)和結(jié)構(gòu)調(diào)整和其他計(jì)劃采取的降本舉措,Sangamo預(yù)計(jì)每年可節(jié)省約3100萬(wàn)美元,為公司提供接下來(lái)12個(gè)月的運(yùn)營(yíng)資金。此外,技術(shù)運(yùn)營(yíng)執(zhí)行副總裁 R. Andrew Ramelmeier 博士將于今年7月離開(kāi)公司。

3月17日,公司公告稱(chēng)Novartis和Biogen分別決定終止了合作協(xié)議:與Novartis合作始于2020年7月,基于ZFN共同開(kāi)發(fā)三個(gè)臨床前CNS管線;與Biogen合作始于2020年2月,基于ZFN和AAV載體共同開(kāi)發(fā)治療tau蛋白病的ST-501、治療PD的ST-502、靶向DM1等四種臨床前基因療法。

去年1月,公司公告稱(chēng)Sanofi決定終止合作協(xié)議:這項(xiàng)始于2014年1月的合作,基于ZFN共同開(kāi)發(fā)治療SCD的臨床前通用型細(xì)胞治療藥物,終止前已進(jìn)入I/II期臨床。

Sangamo的市值已從高點(diǎn)的26億美元,一路滑落至2.7億。

Sangamo因其堅(jiān)持——或者說(shuō)壟斷ZFN技術(shù)路線而知名,總裁兼首席執(zhí)行官和董事會(huì)成員Sandy Macrae博士曾獲得過(guò)諾貝爾醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)(2013年)提名。廣泛的涉及領(lǐng)域、獨(dú)特的研究平臺(tái),還有奪目的合作管線,Sangamo一直是基因治療領(lǐng)域的旗幟之一,但現(xiàn)在,這面孤獨(dú)的旗幟好像已經(jīng)失去了榮耀和色彩。

在Sangamo與ZFN技術(shù)風(fēng)雨飄搖時(shí),另一邊,CRISPR技術(shù)又傳來(lái)新的重磅融資:Beam衍生公司Orbital獲2.7億美元A輪融資,Orbital 將 LNP 和 VLP 以及環(huán)狀 RNA 結(jié)合在一起,正在 RNA 技術(shù)、遞送方法、數(shù)據(jù)科學(xué)和自動(dòng)化的交叉點(diǎn)構(gòu)建一個(gè)技術(shù)平臺(tái),涉足下一代疫苗、蛋白質(zhì)替代品和免疫調(diào)節(jié)劑,并正與大型制藥公司在內(nèi)的潛在合作伙伴溝通合作。

ZFN與CRISPR作為兩代基因編輯工具,其冰火兩重天的現(xiàn)狀值得玩味。

ZFN獨(dú)行俠

Sangamo Therapeutics公司總部位于美國(guó)加州里士滿,于2000年上市。在公司時(shí)任CEO Edward Lanphier的努力下,ZFN技術(shù)從設(shè)計(jì)、優(yōu)化到臨床應(yīng)用的整套技術(shù)體系的專(zhuān)利被Sangamo*鎖定,再也沒(méi)有其它機(jī)構(gòu)從事ZFN的研發(fā)。

ZFN是一個(gè)帶定位系統(tǒng)的基因剪刀,鋅指蛋白用于識(shí)別和結(jié)合特定的基因序列,F(xiàn)okI核酸內(nèi)切酶可以通過(guò)二聚體化特異性地切割目的基因,并且可以切割真核基因組的任意識(shí)別序列。

ZFN的主要優(yōu)勢(shì)在于基因修復(fù)方式多樣、精準(zhǔn)更換基因、對(duì)基因表達(dá)強(qiáng)度影響較小。與CRISPR相比,ZFN作為基因編輯工具的主要劣勢(shì)是開(kāi)發(fā)高質(zhì)量基因編輯產(chǎn)品費(fèi)時(shí)且繁瑣。雖然這種明顯的差異仍然存在,但Sangamo已經(jīng)改進(jìn)了開(kāi)發(fā)過(guò)程,周期由三個(gè)月縮短至10天,并減少了它的費(fèi)用。

由于Sangamo的研究和開(kāi)發(fā)工作,ZFN在基因編輯領(lǐng)域取得了多項(xiàng)*:*個(gè)編輯人類(lèi)細(xì)胞基因、*個(gè)編輯體外基因和*個(gè)編輯體內(nèi)基因。

Sangamo具有先發(fā)優(yōu)勢(shì),但從ZFN被發(fā)現(xiàn)到現(xiàn)在已近40年,Sangamo成立也近30年,公司還尚未有沖線的產(chǎn)品。反觀更晚起步的CRISPR,今年已經(jīng)撞線在即,Vertex Pharmaceuticals 和 CRISPR Therapeutics 提交了用于鐮狀細(xì)胞病和 β 地中海貧血治療的 exa-cel 的 BLA 申請(qǐng),Bluebird bio 提交了基因治療 lovo-cel 上市申請(qǐng)(BLA),用于 12 歲及以上有血管閉塞事件史的鐮狀細(xì)胞?。⊿CD)患者治療。

根據(jù)Sangamo的公開(kāi)信息,其進(jìn)度最快的管線是與輝瑞公司合作的血友病A項(xiàng)目(此前的SB-525),為肝靶向 AAV 基因療法,輝瑞正在主導(dǎo)臨床III期的研究,以評(píng)估在中度或重度 A 型血友病成年男性參與者中的臨床療效和安全性。

▲ Sangamo公司最新管線情況,來(lái)源:公司Q1財(cái)報(bào)

在Sangamo的*季度財(cái)報(bào)電話會(huì)上,公司宣布了接下來(lái)的三大戰(zhàn)略重點(diǎn):

Nav1.7和Prion,這是Sangamo神經(jīng)學(xué)表觀遺傳調(diào)控領(lǐng)域的重點(diǎn)臨床前項(xiàng)目,Nav1.7用于治療慢性神經(jīng)性疼痛,預(yù)計(jì)將于2024年提交IND,Prion計(jì)劃在2025年提交IND。

針對(duì)法布瑞氏癥(此前的ST-920)的III期臨床準(zhǔn)備,該病是因X染色體上出現(xiàn)缺陷而導(dǎo)致的遺傳疾病,它主要是因制造α-半乳糖甘酵素的基因發(fā)生缺陷,Sangamo表示其產(chǎn)品在I/II期試驗(yàn)中已展現(xiàn)出良好的安全性,正在推進(jìn)III期試驗(yàn)的計(jì)劃。

TX200 CAR-Treg 臨床研究,TX200用于實(shí)體器官移植,Sangamo計(jì)劃通過(guò)I/II期臨床研究推進(jìn) TX200在腎移植中的應(yīng)用,并計(jì)劃加速劑量遞增。

從公司最新的管線列表可以看到,Sangamo的重點(diǎn)項(xiàng)目全部為自有管線,合作項(xiàng)目和此前比可以用寥寥無(wú)幾來(lái)形容。Sangamo在獨(dú)行俠的路上似乎越走越遠(yuǎn)。

技術(shù)發(fā)展,需要開(kāi)枝散葉

當(dāng)業(yè)內(nèi)對(duì)比ZFN與CRISPR時(shí),無(wú)一不提到ZFN面臨的一大問(wèn)題是專(zhuān)利上的封鎖。

專(zhuān)利一直是基因治療領(lǐng)域的關(guān)鍵競(jìng)爭(zhēng)壁壘,Sangamo干脆從源頭避免這個(gè)問(wèn)題,所以ZFN領(lǐng)域只有Sangamo自己摸索前路,這也導(dǎo)致ZFN技術(shù)自問(wèn)世至今沒(méi)有獲得大規(guī)模的應(yīng)用,也沒(méi)有突破性進(jìn)展。

CRISPR技術(shù)則在“不那么體面”的專(zhuān)利之爭(zhēng)中迅速發(fā)展。2013年11月,張鋒連同Doudna等人共同建立了Editas Medicine,但最終由于專(zhuān)利方面未談攏,Doudna便選擇了單飛并于2014年創(chuàng)立了Intellia Therapeutics。此外,Charpentier也沒(méi)有閑著,其同樣于2013年創(chuàng)立了CRISPR Therapeutics。如今,這三家企業(yè)已成為CRISPR基因編輯技術(shù)領(lǐng)域的頭部企業(yè)。

CRISPR在一路的專(zhuān)利紛爭(zhēng)中,不斷有細(xì)分路徑出現(xiàn),如2016年堿基編輯出現(xiàn),可以做到定點(diǎn)的修飾某一個(gè)或者某幾個(gè)點(diǎn)突變,能夠定向改變基因組中某個(gè)特定位置的特定堿基,并且只改變單個(gè)目標(biāo)堿基,而不會(huì)影響到其他堿基;2019年劉如謙博士公開(kāi)的引導(dǎo)編輯可以實(shí)現(xiàn)4種堿基之間的任意變換及小片段的精準(zhǔn)插入和刪除。

▲ ZFN與CRISPR技術(shù)相關(guān)公司時(shí)間線/ 動(dòng)脈新醫(yī)藥整理

針對(duì)專(zhuān)利問(wèn)題,布局CRISPR技術(shù)的眾多公司一方面想辦法繞開(kāi)CRISPR-Cas9,另一方面,在想辦法爭(zhēng)奪尚未塵埃落定的專(zhuān)利。輝大基因自主開(kāi)發(fā)的CRISPR-Cas13系統(tǒng)——Cas13X(也稱(chēng)為Cas13e)和Cas13Y(也稱(chēng)為Cas13f),既可以降低RNA的靶基因表達(dá),還可以通過(guò)改造與脫氨酶結(jié)合進(jìn)而實(shí)現(xiàn)RNA單堿基編輯,且編輯效率接近80%;吐露港生物(ToloBio)在美國(guó)申請(qǐng)Cas12蛋白診斷專(zhuān)利,公司利用Cas12a的反式切割活性開(kāi)發(fā)了HOLMES診斷系統(tǒng),在專(zhuān)利上與Mammoth Biosciences展開(kāi)了艱難的競(jìng)爭(zhēng)并擊敗對(duì)手。

這一切,讓CRISPR領(lǐng)域更顯百花齊放的狀態(tài)。

反觀Sangamo,公司之外的科學(xué)家們?nèi)詿o(wú)法了解其篩選和優(yōu)化ZFN技術(shù)的詳細(xì)過(guò)程,在此之上的進(jìn)一步完善和進(jìn)步當(dāng)然無(wú)從談起。要讓技術(shù)飛速成長(zhǎng)、開(kāi)花結(jié)果,Sangamo公司內(nèi)部的少數(shù)科學(xué)家遠(yuǎn)遠(yuǎn)不足以實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)。就算學(xué)術(shù)界的科學(xué)家想要利用Sangamo公司的技術(shù)進(jìn)行基礎(chǔ)研究,比如對(duì)某個(gè)生物的基因進(jìn)行定點(diǎn)突變并研究其生理功能,也只能委托Sangamo公司設(shè)計(jì)和完成,堪稱(chēng)是黑箱操作。ZFN原本基礎(chǔ)研究和臨床應(yīng)用方面都表現(xiàn)出色,卻被限制在Sangamo公司內(nèi)部,無(wú)法釋放其潛力,喪失了原本的先發(fā)優(yōu)勢(shì)。

從某種意義上說(shuō),Sangamo公司對(duì)專(zhuān)利的*保護(hù),作為商業(yè)實(shí)踐可能還是會(huì)寫(xiě)進(jìn)許多商學(xué)院和法學(xué)院的案例教材,被人長(zhǎng)久討論,但ZFN技術(shù)和其相關(guān)的研究是否能被銘記,要被打一個(gè)問(wèn)號(hào)。畢竟不論在科學(xué)上的爭(zhēng)執(zhí)還是商業(yè)上的競(jìng)賽,最終是為了釋放造福人類(lèi)的潛力。

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